হিসাবের সুবিধার্থে জামিয়ার যাবতীয় আর্থিক লেনদেন মোট পাঁচটি ফান্ডে বিভক্ত করা হয়েছে

• জেনারেল ফান্ড
• ইমদাদ বা গোরাবা ফান্ড
• বিল্ডিং ফান্ড
• মসজিদ ফান্ড
• কুতুবখানা ফান্ড

দায়িত্বশীলবৃন্দ

১. মাওলানা ইয়াকুব আলী
২. মাওলানা মাজেদুল হক